Por lo tanto necesitas esto:

No obstante pienso que no está muy claro que no pueda funcionar ya que en un principio tienen el mismo sistema constructivo...
¿Que quiero decir?
Pues sencillo que el conector USB contiene alimentación y si los cables están colocados en el mismo orden que en el DB9 no abrá problema pero si está colocado de manera que pueda "cortocicuitar" el aparato conectado..., ahí puede haber el problema.
Además las conexiones USB son de 9 pines para situar correctamente el conector que normalmente son para dos USB.
Cada USB son de 4 cables:

Y el puerto DB9 necesita las 9 conexiones

Como puedes ver no es lo mismo....
No obstante hay en el mercado convertidores de DB9 / RS232 -> USB con lo que te solucionará la papeleta. no son muy caros
http://www.pccomponentes.com/cables_serie_paralelo.html
Espero que te aclare algo....
Una pregunta ¿Que tienes conectado en el conector de 10 pines con el cable rojo y amarillo?
Un saludo